Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms