Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD1B0YJ81 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.9 ms