Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOBPA7XYQ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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