Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms