Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPOPA6NHQ4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms