Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5orf60A6NFR6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf60A6NFR6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms