Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L4A6NEF3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms