Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms