Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRGMA1A4Y4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms