Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PQD8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PQD8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQD8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQD8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms