Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YYE9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms