Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV4-1A0A0J9YWV2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV4-1A0A0J9YWV2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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