Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087X0T9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X0T9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X0T9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms