Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 OR10G3-203ENST00000641185 2640 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC092447.8-201ENST00000566570 4162 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC113208.3-201ENST00000637356 2523 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 NEFL-201ENST00000610854 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CLPB-203ENST00000437826 3379 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 RCVRN-201ENST00000226193 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TRPV5-201ENST00000265310 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PSMG3-AS1-203ENST00000457484 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 USP1-201ENST00000339950 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SLC33A1-201ENST00000359479 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 RNF6-203ENST00000381588 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LINC00923-201ENST00000503768 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PLEKHG5-204ENST00000377732 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ACBD5-205ENST00000396271 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PRPF4-202ENST00000374199 3212 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PIK3CD-201ENST00000361110 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ST3GAL5-254ENST00000640322 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 GTF2IP20-203ENST00000634905 2966 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PDE8A-208ENST00000557957 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ZIK1-207ENST00000599456 2860 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 FCRL2-201ENST00000361516 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CCDC149-202ENST00000389609 2127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 STAG3L4-202ENST00000416602 2143 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 UBE2V1-207ENST00000420027 1956 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TYR-201ENST00000263321 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LRP2-202ENST00000443831 4007 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PPFIA2-211ENST00000548586 4033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LINC00857-201ENST00000422847 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL357509.1-201ENST00000641892 2013 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TAS1R1-202ENST00000351136 1871 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ACVR2B-AS1-201ENST00000441531 2517 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SATB2-AS1-205ENST00000450728 3314 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC010326.4-202ENST00000603829 541 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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