Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TAF5L-203ENST00000366675 4062 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CRISPLD2-201ENST00000262424 4586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 VRTN-201ENST00000256362 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TPX2-201ENST00000300403 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PSMD1-202ENST00000373635 3230 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ZP1-201ENST00000278853 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CFAP157-202ENST00000373295 1721 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC005537.1-203ENST00000629291 1748 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ANKRD26P1-201ENST00000566201 3921 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NAGA-201ENST00000396398 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL3-201ENST00000286744 7336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ABHD17B-201ENST00000333421 2614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LINC02080-201ENST00000585863 3085 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TIAM2-202ENST00000318981 5916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 UBASH3A-201ENST00000291535 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SYT10-201ENST00000228567 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PALM2-202ENST00000374531 4492 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ISG20L2-201ENST00000313146 3303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ENOX2-203ENST00000370935 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CD163L1-201ENST00000313599 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TECTA-202ENST00000392793 7426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 THUMPD1-201ENST00000381337 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CASP7-210ENST00000614447 2555 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 C6orf163-203ENST00000608326 2110 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MIR6770-3-201ENST00000616362 60 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MIR6770-2-201ENST00000618304 60 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MIR6770-1-201ENST00000622248 60 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LRP2-202ENST00000443831 4007 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 OR4D9-203ENST00000641962 6123 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TACC2-204ENST00000360561 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SLC7A6OS-201ENST00000263997 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LGALS9-203ENST00000395473 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL118508.3-201ENST00000623468 1854 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MPP2-203ENST00000461854 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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