Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms