Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTF3C3Q9Y5Q9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms