Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.9 ms