Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNPO3Q9Y5L0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms