Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTDP1Q9Y5B0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDP1Q9Y5B0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms