Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms