Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED5Q9Y3A6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED5Q9Y3A6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms