Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIK3Q9Y2K2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIK3Q9Y2K2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms