Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.79■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.79■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.78■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC51.78■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.78■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.78■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC51.78■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC51.77■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC51.77■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC51.77■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC51.77■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.77■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC51.76■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC51.76■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC51.75■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC51.75■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC51.75■■■■■ 5.88
NISCHQ9Y2I1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC51.74■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC51.73■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC51.73■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.72■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.72■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC51.71■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC51.71■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.7■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC51.7■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC51.69■■■■■ 5.87
NISCHQ9Y2I1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC51.69■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC51.69■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.68■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC51.68■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.68■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC51.68■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC51.68■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC51.67■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC51.67■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC51.67■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC51.65■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC51.64■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC51.64■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC51.64■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.64■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC51.64■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC51.64■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.64■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC51.64■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC51.63■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC51.63■■■■■ 5.86
NISCHQ9Y2I1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC51.62■■■■■ 5.85
NISCHQ9Y2I1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
NISCHQ9Y2I1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
NISCHQ9Y2I1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC51.61■■■■■ 5.85
NISCHQ9Y2I1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
NISCHQ9Y2I1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
NISCHQ9Y2I1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
NISCHQ9Y2I1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC51.6■■■■■ 5.85
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