Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC5Q9UQL6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC5Q9UQL6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms