Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNND2Q9UQB3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms