Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN6Q9UQ52 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN6Q9UQ52 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms