Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD4AQ9UPU9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms