Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX6Q9UNH7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX6Q9UNH7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms