Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNRGQ9UMZ2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNRGQ9UMZ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNRGQ9UMZ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNRGQ9UMZ2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNRGQ9UMZ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNRGQ9UMZ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNRGQ9UMZ2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNRGQ9UMZ2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNRGQ9UMZ2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNRGQ9UMZ2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 652 ms