Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF1Q9UMS5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms