Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
INO80Q9ULG1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
INO80Q9ULG1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms