Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCTN4Q9UJW0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms