Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIY3

RWDD2A, RWD domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2AQ9UIY3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD2AQ9UIY3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RWDD2AQ9UIY3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD2AQ9UIY3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD2AQ9UIY3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD2AQ9UIY3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms