Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZNF639Q9UID6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF639Q9UID6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms