Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA4Q9UI42 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms