Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM10Q9UDY6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms