Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF1Q9UBU9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms