Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DBF4Q9UBU7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DBF4Q9UBU7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms