Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCOR3Q9P2K3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms