Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARSQ9P2J5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LARSQ9P2J5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms