Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHPF2Q9P2E5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms