Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMCD1Q9NZU5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms