Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYOFQ9NZM1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms