Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PODXL2Q9NZ53 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms