Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MTMR4Q9NYA4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR4Q9NYA4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms