Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMTM6Q9NX76 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM6Q9NX76 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms