Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DDX18Q9NVP1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDX18Q9NVP1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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