Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A9Q9NUM3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms