Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms