Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNIP2Q9NS61 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms